Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timm44O35857 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timm44O35857 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms