Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk2O35491 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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