Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Edil3O35474 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edil3O35474 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edil3O35474 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Edil3O35474 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edil3O35474 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edil3O35474 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edil3O35474 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edil3O35474 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Edil3O35474 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Edil3O35474 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edil3O35474 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edil3O35474 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edil3O35474 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms