Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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H2-ObO35424 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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H2-ObO35424 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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H2-ObO35424 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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