Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms