Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms