Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra2O08842 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra2O08842 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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