Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms