Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms