Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3239L7N2D9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms