Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm2056J3QQ02 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms