Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer2J3QPU5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms