Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam240aJ3QNP9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms