Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms