Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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