Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms