Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ankrd50F7BE84 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ankrd50F7BE84 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ankrd50F7BE84 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ankrd50F7BE84 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd50F7BE84 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ankrd50F7BE84 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ankrd50F7BE84 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ankrd50F7BE84 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd50F7BE84 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms