Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1bF6V0H0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms