Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrdnE9Q9K5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms