Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip11E9Q512 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms