Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo5cE9Q1F5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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