Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms