Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms