Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc144bE9PVZ3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms