Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8994E9PV04 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8994E9PV04 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms