Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim12cD3Z3L3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms