Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6685D3YYP3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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