Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kif28pD3YXS5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms