Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30cD3YVI9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms