Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rfx8D3YU81 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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