Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfap1bC0HKD9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms