Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spocd1B1ASB6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms