Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms