Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tubb1A2AQ07 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tubb1A2AQ07 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tubb1A2AQ07 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tubb1A2AQ07 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubb1A2AQ07 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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