Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syndig1A2ANU3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms