Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn34c4A2ANA3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c4A2ANA3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms