Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc183A2AJB1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc183A2AJB1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms