Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam171a2A2A699 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam171a2A2A699 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms