Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r25W4VSP2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms