Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Speer3W4VSP1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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