Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28036V9GXJ1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms