Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afb2S4R1M3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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