Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms