Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcniQ9Z2V9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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