Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms