Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Crlf3Q9Z2L7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms