Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Stk39Q9Z1W9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Stk39Q9Z1W9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Stk39Q9Z1W9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Stk39Q9Z1W9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Stk39Q9Z1W9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stk39Q9Z1W9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Stk39Q9Z1W9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Stk39Q9Z1W9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Stk39Q9Z1W9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Stk39Q9Z1W9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Stk39Q9Z1W9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Stk39Q9Z1W9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Stk39Q9Z1W9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms