Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syngr4Q9Z1L2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms