Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cldn3Q9Z0G9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cldn3Q9Z0G9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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