Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnni1Q9WUZ5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms